Cơ cấu tổ chức của Công ty Cổ phần Công trình công cộng Hội An gồm 4 phòng chức năng:

• Phòng Kinh Doanh
• Phòng Tổ chức – Hành chính
• Phòng Kế toán - Tài chính
• Phòng Kế hoạch Kỹ thuật

01 Chi nhánh Công viên xây xanh; 01 CN thu gom vận chuyển, 01 CN DVCI Cù Lao Chàm, 24 đội nghiệp vụ bao gồm: Đội điện chiếu sáng, Đội công trình và 01 Nhà máy xử lý rác.